H-InvDB x AHG DB
Transcript view
H-InvDB_9.0 released on May 27, 2015.
Search by for Advanced Search
Home Quick guide Navi BLAST Site map Download Contact us Help
H-Invitational ID: HIT000217542 Accession number: U04245 Created date: 26-Mar-2013 Last modified: 27-May-2015
Definition: HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain; MHC class I antigen B*7; Precursor;
 
 

Gene function information  Gene family PPI viewer Similarity Search Tool TACT
H-Inv ID HIT000217542
H-Inv cluster ID Locus viewHIX0207383
Accession number U04245.1
CAGE tag ID NA
EST ID NA
Transcript feature  Help NO; 
Coding potential  Help Protein coding; 
Definition HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain; MHC class I antigen B*7; Precursor;
Similarity category  Help Category: Identical to known human protein(Category I).
Identical to known human protein (P01889)  [Identity/coverage = 99.724%/100.0%] to Homo sapiens (Human). protein.
Experimental evidence Protein evidence
PubMed ID 5188652320591270094429931617652739787865881062708537119877332311390610115569731262277414574404147020391915921821269460ALL
Gene family/group Gene family H-Inv gene family/group ID NA
Gene family/group name NA
Evidence motif (InterPro) ID NA
Gene symbol/name HGNC symbol HLA-C
HGNC aliases "psoriasis susceptibility 1"
HGNC name major histocompatibility complex, class I, C
DDBJ HLA-B
UniProt HLA-B
EC number NA
GGDB
(GlycoGene Database)
Gene symbol NA
Familly NA
Designation NA
Expression NA
KEGG metabolic pathway NA
Protein-protein interaction (PPI) PPI viewer H-Inv protein ID HIP000077012
No. of interaction 5
Interaction partner(s) HIP000051059HIP000054674HIP000088649HIP000095079HIP000116126
BIND 111056;  117143;  74432; 
DIP 10960E;  112765E;  112795E;  112796E;  112806E;  112807E;  112819E;  112827E;  112872E;  112875E;  112876E;  112896E;  112907E;  112912E;  112923E;  112937E;  112939E;  112941E;  112950E;  112952E;  112953E;  112962E;  112964E;  112968E;  112982E;  113184E;  113193E;  113209E;  113210E;  113221E;  113224E;  113263E;  113266E;  113277E;  113287E;  113461E;  113467E;  113468E;  113469E;  113471E;  113477E;  113478E;  113479E;  113483E;  113486E;  113507E;  113516E;  113518E;  113520E;  113527E;  113551E;  114646E;  115402E;  115408E;  115440E;  115441E;  115444E;  115448E;  115452E;  115468E;  115472E;  115475E;  115479E;  115489E;  115497E;  115522E;  115529E;  115532E;  115608E;  115622E;  115634E;  115635E;  115650E;  115667E;  115676E;  115690E;  115696E;  115702E;  115793E;  115807E;  115812E;  115906E;  115939E;  115954E;  115981E;  115986E;  116007E;  116008E;  116009E;  116013E;  116022E;  116030E;  116040E;  116041E;  116055E;  116061E;  116063E;  116071E;  116089E;  116101E;  116108E;  116115E;  116138E;  116140E;  116141E;  116146E;  116160E;  116185E;  116187E;  116190E;  116214E;  116225E;  116227E;  116230E;  116234E;  116235E;  116240E;  116243E;  116248E;  116252E;  116270E;  116284E;  116291E;  116300E;  116316E;  116324E;  116331E;  116332E;  116335E;  116348E;  116355E;  116356E;  116362E;  116407E;  116413E;  116416E;  116421E;  116426E;  116433E;  116435E;  116446E;  116448E;  116457E;  116491E;  116494E;  116495E;  116499E;  116502E;  116506E;  116513E;  116518E;  116540E;  116543E;  116544E;  116574E;  116577E;  116591E;  116598E;  116614E;  116623E;  116637E;  116649E;  116654E;  116663E;  116680E;  116693E;  116698E;  116716E;  116721E;  116731E;  116736E;  116740E;  116761E;  116765E;  116778E;  116795E;  116805E;  116818E;  116820E;  116824E;  116826E;  116840E;  116852E;  116855E;  116889E;  116902E;  116903E;  116906E;  116917E;  116921E;  116922E;  116931E;  116947E;  116955E;  116965E;  116975E;  116977E;  116983E;  116989E;  116993E;  117009E;  117021E;  117024E;  117037E;  117056E;  117064E;  117080E;  117096E;  117107E;  117114E;  117124E;  117130E;  117134E;  117143E;  117159E;  117161E;  117171E;  117172E;  117174E;  117176E;  117179E;  117196E;  117200E;  117201E;  117208E;  117211E;  117212E;  117213E;  117228E;  117243E;  117246E;  117258E;  117264E;  117271E;  117272E;  117276E;  117289E;  117291E;  117292E;  117293E;  117307E;  117311E;  117328E;  117336E;  117344E;  117357E;  117368E;  117370E;  117426E;  117429E;  117436E;  117442E;  117450E;  117454E;  117455E;  117464E;  117465E;  117488E;  117507E;  117523E;  117538E;  117539E;  117560E;  117577E;  117578E;  117579E;  117582E; 
MINT MINT-24861; 
HPRD 00006;  00034;  00050;  00071;  00074;  00136;  00142;  00189;  00241;  00242;  00243;  00267;  00388;  00424;  00458;  00465;  00475;  00479;  00562;  00684;  00687;  00701;  00717;  00753;  00784;  00785;  00895;  01036;  01047;  01056;  01061;  01091;  01145;  01247;  01248;  01323;  01384;  01385;  01391;  01401;  01403;  01451;  01456;  01469;  01487;  01496;  01539;  01543;  01559;  01567;  01588;  01598;  01605;  01621;  01736;  01737;  01743;  01761;  01762;  01812;  01819;  01876;  01987;  02006;  02021;  02059;  02114;  02133;  02154;  02155;  02319;  02338;  02388;  02399;  02535;  02538;  02553;  02589;  02617;  02630;  02673;  02714;  02804;  02831;  02832;  02924;  02934;  03013;  03042;  03074;  03091;  03108;  03110;  03128;  03204;  03297;  03334;  03347;  03445;  03485;  03495;  03536;  03603;  03671;  03685;  03709;  03710;  03714;  03794;  03799;  03805;  03839;  03861;  04068;  04072;  04084;  04086;  04159;  04171;  04188;  04204;  04231;  04269;  04379;  04385;  04386;  04567;  04568;  04574;  04595;  04628;  04629;  04676;  04696;  04884;  04885;  04887;  04888;  04947;  05023;  05137;  05143;  05247;  05331;  05381;  05401;  05466;  05496;  05500;  05507;  05816;  05829;  05868;  05870;  05895;  05984;  06085;  06120;  06138;  06343;  06425;  06501;  06634;  06693;  06714;  06734;  06750;  06843;  06850;  06921;  07137;  07262;  07273;  07503;  07539;  07574;  07608;  08864;  08912;  08924;  08993;  09143;  09226;  09277;  09299;  09573;  09675;  09752;  09768;  09783;  09811;  09815;  09887;  10034;  10122;  10153;  10169;  10170;  10362;  10365;  10367;  10471;  10578;  10927;  11469;  11656;  11658;  11994;  12050;  12174;  13334;  14851;  15181;  15280;  15979;  15998;  16034;  16048;  16070;  16088;  16221;  16274;  17984;  17997;  18128;  18171;  18310;  18370;  18683; 
IntAct NA
Database links RefSeq NA
Ensembl NA
Entrez Gene Entrez Gene ID:3106
KEGG GENES KEGG GENES(3106)
GeneCard GeneCardHLA-C*GeneCards is provided free to academic non-profit institutions.
etc H-GOLDHuman-Gene diversity Of Life-style related Diseases
Curation status Auto-annotated
Notes NA
Related H-InvDB links Gene familyGene family;  Similarity Search ToolSimilarity Search Tool;  TACTTACT
fRNAdb (The functional RNA database) : overlapping fRNAdb entries with H-InvDB transcripts based on the location of the genome. 
FR ID FR265415
Accession
Description
Location
PMID