H-InvDB_8.3 released on March 26, 2013.
Search by
Keyword
H-Inv ID (HIT)
H-Inv cluster ID (HIX)
H-Inv protein ID (HIP)
H-Inv gene family/group (HIF)
Accession number
Chromosome number
Chromosome band
Definition*
Data source ID
---
CCDS ID
dbSNP ID (rs number)
EC number
Ensembl ID
EntrezGene ID
FR ID
FR Accession number
GO ID
GO name*
HGNC gene symbol
HGNC gene name*
InterPro ID
InterPro name*
OMIM ID
OMIM title*
Pathway ID
Pathway name*
RefSeq (gene) ID
RefSeq (protein) ID
SCOP ID
UniProt
for
Advanced Search
Home
Quick guide
Navi
BLAST
Site map
Download
Contact us
Help
Transcript view
Protein view
G-integra
DiseaseInfo Viewer
H-ANGEL
Evola
PPI view
Gene Family/Group
Hyperlink MS
H-Inv cluster ID:
HIX0005252
Created date:
26-Mar-2013
Last modified:
20-Apr-2012
Definition:
Protocadherin gamma-A1 isoform 1 precursor.
Select format
Flat file
XML file
Gene structure
H-Inv cluster ID
HIX0005252
Genomic location
Chromosome
5
Location
5q31.3
Position
140710204- 140892548
Strand
+
Antisense cluster ID(s)
HIX0164292
overlap at CDSs (all)
Database links
RefSeq
NM_032407
;
Ensembl
ENST00000394576
;
ENST00000523390
;
ENST00000518069
;
ENST00000253812
;
ENST00000252085
;
ENST00000378105
;
ENST00000252087
;
ENST00000306593
;
ENST00000522605
;
ENST00000518882
;
ENST00000305759
;
ENST00000398587
;
ENST00000528330
;
ENST00000308177
;
ENST00000520790
;
ENST00000518325
;
ENST00000517434
;
ENST00000398604
;
ENST00000517417
;
ENST00000398594
;
ENST00000398610
;
Entrez Gene
Entrez Gene ID:56099
;
Entrez Gene ID:56098
;
Entrez Gene ID:56097
;
Entrez Gene ID:5098
;
Entrez Gene ID:56110
;
Entrez Gene ID:56101
;
Entrez Gene ID:56100
;
Entrez Gene ID:56103
;
Entrez Gene ID:8641
;
Entrez Gene ID:56102
;
Entrez Gene ID:56105
;
Entrez Gene ID:56114
;
Entrez Gene ID:9708
;
Entrez Gene ID:56113
;
Entrez Gene ID:56104
;
Entrez Gene ID:56112
;
Entrez Gene ID:56107
;
Entrez Gene ID:56106
;
Entrez Gene ID:56111
;
Entrez Gene ID:56109
;
Entrez Gene ID:56108
;
Entrez Gene ID:26025
;
KEGG GENES
KEGG GENES(56114)
;
GeneCard
PCDHGA12
;
PCDHGA10
;
PCDHGA11
;
PCDHGA9
;
PCDHGB7
;
PCDHGA8
;
PCDHGC5
;
PCDHGB6
;
PCDHGA7
;
PCDHGC4
;
PCDHGA6
;
PCDHGC3
;
PCDHGA5
;
PCDHGA4
;
PCDHGB3
;
PCDHGA3
;
PCDHGB2
;
PCDHGB5
;
PCDHGA2
;
PCDHGB4
;
PCDHGA1
;
PCDHGB1
;
*GeneCards is provided free to academic non-profit institutions.
etc
Human-Gene diversity Of Life-style related Diseases
;
Cluster member H-Inv ID(s)
HIT000071744
;
HIT000053681
;
HIT000000305
;
HIT000038619
;
HIT000040148
;
HIT000000033
;
HIT000009462
;
HIT000052733
;
HIT000031863
;
HIT000071748
;
HIT000071756
;
HIT000071750
;
HIT000071757
;
HIT000071751
;
HIT000435698
;
HIT000071758
;
HIT000435515
;
HIT000071752
;
HIT000071753
;
HIT000071759
;
HIT000071754
;
HIT000071760
;
HIT000071755
;
HIT000071761
;
HIT000071745
;
HIT000071762
;
HIT000071746
;
HIT000500770
;
HIT000503505
;
HIT000071808
;
HIT000071747
;
HIT000032835
;
HIT000260897
;
HIT000040259
;
HIT000071763
;
HIT000071764
;
HIT000071765
;
HIT000252990
;
HIT000436006
;
HIT000071830
;
HIT000500739
;
HIT000500738
;
HIT000334854
;
HIT000334852
;
HIT000071829
;
HIT000336446
;
HIT000336448
;
HIT000071828
;
HIT000500700
;
HIT000500701
;
HIT000334846
;
HIT000338038
;
HIT000338014
;
HIT000386913
;
HIT000390822
;
HIT000337152
;
HIT000071807
;
HIT000071809
;
HIT000387060
;
HIT000340217
;
HIT000071814
;
HIT000071820
;
HIT000071811
;
HIT000071812
;
HIT000071810
;
HIT000071815
;
HIT000071819
;
HIT000071826
;
HIT000071817
;
HIT000071825
;
HIT000071818
;
HIT000071823
;
HIT000071816
;
HIT000071822
;
HIT000071821
;
HIT000337479
;
HIT000337478
;
HIT000071827
;
HIT000071824
;
HIT000071813
;
HIT000328862
;
HIT000329113
;
HIT000328893
;
HIT000192062
;
HIT000040264
;
HIT000340210
;
HIT000340212
;
HIT000334850
;
HIT000334848
;
HIT000336447
;
HIT000340211
;
HIT000340213
;
HIT000386332
;
HIT000088424
;
HIT000337480
;
HIT000285956
;
HIT000386507
;
HIT000192060
;
HIT000102022
;
HIT000102025
;
HIT000071749
;
HIT000328443
;
HIT000293652
;
HIT000290450
;
HIT000292090
;
HIT000293628
;
HIT000284119
;
HIT000057938
;
HIT000057939
;
HIT000441042
;
Additional cluster member candidate(s)
NA
Related H-InvDB links
H-DBAS
;
G-integra
;
cDNA-genome multiple alignment
;
ORF multiple alignment
;