bases per tick :
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500
200
100
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10
5
2
kb first site :
homology :
R.norvegicus
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSRNOT00000046555
Representative transcript
genome : 137,890,539 - 137,902,649 (12,111)
query : 1 - 615 (615/615)
2 exons
identity = 0.990
3'(0.900)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001073124
genome : 137,908,851 - 137,933,414 (24,564)
query : 1 - 5,071 (5,071/5,071)
27 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000;0.990;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_343119
genome : 137,909,705 - 137,931,131 (21,427)
query : 1 - 4,033 (4,033/4,043)
26 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 0.998
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSRNOT00000019213
genome : 137,909,705 - 137,931,131 (21,427)
query : 1 - 4,033 (4,033/4,033)
26 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSRNOT00000019066
genome : 137,909,983 - 137,930,798 (20,816)
query : 1 - 3,600 (3,600/3,600)
25 exons
identity = 0.998
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
U70050
Representative transcript
genome : 137,909,983 - 137,930,798 (20,816)
query : 1 - 3,609 (3,609/3,609)
25 exons
identity = 0.997
3'(0.992;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;0.991;0.983;0.993;0.981;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;0.996)5'
coverage = 1.000
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000062993
Pan
sp. (Chimpanzee) : ENSPTRT00000012518
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000007327
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001097477
Mus
sp. (Mouse) : AF038572
Canis
sp. (Dog) : XM_548004
Equus
sp. (Horse) : XM_001494763
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001368356
Gallus
sp. (Chicken) : D87558
Danio
sp. (Zebrafish) : AF229449
Danio
sp. (Zebrafish) : ENSDART00000025007
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000001189
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000022193
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000022382
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00023297001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000149799
XM_001073187
Representative transcript
genome : 137,935,983 - 137,942,961 (6,979)
query : 1 - 806 (806/806)
5 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000096773
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_001141720
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000007328
Macaca
sp. (Macaque) : AB046098
Mus
sp. (Mouse) : AK003991
Canis
sp. (Dog) : XM_850433
Equus
sp. (Horse) : XM_001494780
Gallus
sp. (Chicken) : AJ720567
Danio
sp. (Zebrafish) : BC124644
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000022195
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00014414001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000149808
XM_216799
genome : 137,935,983 - 137,942,961 (6,979)
query : 1 - 806 (806/806)
5 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSRNOT00000019550
genome : 137,935,991 - 137,942,943 (6,953)
query : 1 - 780 (780/780)
5 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
AABR03049760.1
137900390-137931272 W +
50
137931273-137931322 N
AABR03049717.1
137931323-137940389 W +