bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
M.domestica
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSMODT00000000103
genome : 49,361,808 - 49,402,452 (40,645)
query : 1 - 1,854 (1,854/1,854)
14 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSMODT00000039344
genome : 49,361,808 - 49,402,452 (40,645)
query : 1 - 1,806 (1,806/1,806)
13 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001364206
Representative transcript
genome : 49,361,808 - 49,402,452 (40,645)
query : 1 - 1,899 (1,899/1,899)
13 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000384900_01
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_001137782
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000023415
Rattus
sp. (Rat) : L78306
Canis
sp. (Dog) : XM_846562
Gallus
sp. (Chicken) : CR353003
Danio
sp. (Zebrafish) : BC055218
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000013669
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000139382
ENSMODT00000039343
genome : 49,361,808 - 49,400,885 (39,078)
query : 1 - 1,842 (1,842/1,842)
13 exons
identity = 0.987
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;0.944;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001362259
Representative transcript
genome : 49,416,893 - 49,421,050 (4,158)
query : 1 - 1,485 (1,485/1,485)
4 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000289144
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_020449
Pongo
sp. (Orangutan) : CR860963
Macaca
sp. (Macaque) : XR_009709
Mus
sp. (Mouse) : X70847
Rattus
sp. (Rat) : BC059108
Canis
sp. (Dog) : XM_859099
Equus
sp. (Horse) : XM_001492467
Takifugu
sp. (Fugu) : AB183683
H.sapiens
(Human) : HIT000295353_03
Macaca
sp. (Macaque) : XR_011287
Canis
sp. (Dog) : XM_537947
Gallus
sp. (Chicken) : AJ719767
Danio
sp. (Zebrafish) : BC154209
Danio
sp. (Zebrafish) : NM_001128732
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000002468
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : CR664126
ENSMODT00000000110
genome : 49,417,001 - 49,420,579 (3,579)
query : 1 - 906 (906/906)
4 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Contig
49342130-49422129 F +