bases per tick :
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1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
E.caballus
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
XM_001499841
Representative transcript
genome : 39,427,214 - 39,470,366 (43,153)
query : 1 - 4,094 (4,094/4,094)
22 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000042334
Pan
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Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000016190
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001100342
Mus
sp. (Mouse) : AK150275
Rattus
sp. (Rat) : BC131852
Canis
sp. (Dog) : XM_541898
Bos
sp. (Cow) : ENSBTAT00000020961
Monodelphis
sp. (Opossum) : ENSMODT00000018026
Gallus
sp. (Chicken) : CR386838
Danio
sp. (Zebrafish) : ENSDART00000058590
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000019870
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00006835001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000148155
ENSECAT00000026470
genome : 39,427,312 - 39,470,363 (43,052)
query : 1 - 3,990 (3,990/3,990)
22 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001495506
Representative transcript
genome : 39,470,659 - 39,502,139 (31,481)
query : 1 - 5,170 (5,170/5,170)
25 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000058813
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_023600
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000016191
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001100428
Mus
sp. (Mouse) : BC059902
Rattus
sp. (Rat) : AF077000
Canis
sp. (Dog) : XM_846437
Bos
sp. (Cow) : BC120008
Monodelphis
sp. (Opossum) : ENSMODT00000018000
Danio
sp. (Zebrafish) : NM_001044928
Danio
sp. (Zebrafish) : XM_001345775
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000019855
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000148152
ENSECAT00000017855
genome : 39,470,860 - 39,502,222 (31,363)
query : 1 - 5,052 (5,052/5,052)
25 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
contig_8533
39408790-39488789 W +