bases per tick :
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1000
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200
100
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20
10
5
2
kb first site :
homology :
E.caballus
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSECAT00000026866
Representative transcript
genome : 73,089,842 - 73,140,130 (50,289)
query : 1 - 1,678 (1,678/1,678)
8 exons
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000094231
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_517649
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000018193
Macaca
sp. (Macaque) : ENSMMUT00000001711
Mus
sp. (Mouse) : AK144817
Rattus
sp. (Rat) : ENSRNOT00000029250
Canis
sp. (Dog) : ENSCAFT00000012646
Bos
sp. (Cow) : BT021746
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001364779
Gallus
sp. (Chicken) : AJ720194
Danio
sp. (Zebrafish) : BC124212
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000012968
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00018820001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000140439
XM_001503703
genome : 73,089,870 - 73,140,112 (50,243)
query : 1 - 1,632 (1,632/1,632)
8 exons
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_001918332
Representative transcript
genome : 73,140,377 - 73,215,662 (75,286)
query : 1 - 5,710 (5,710/5,710)
43 exons
identity = 0.999
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000000078
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_022885
Macaca
sp. (Macaque) : XR_011266
Mus
sp. (Mouse) : EF591876
Rattus
sp. (Rat) : ENSRNOT00000062017
Canis
sp. (Dog) : XM_536294
Bos
sp. (Cow) : XM_613739
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001364919
Gallus
sp. (Chicken) : XM_424706
Danio
sp. (Zebrafish) : XM_685671
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000012936
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000140442
ENSECAT00000027077
genome : 73,147,351 - 73,214,947 (67,597)
query : 1 - 4,930 (4,930/4,930)
41 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
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1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
contig_2923
73138019-73149396 W +
1388
73149397-73150784 N
contig_2924
73150785-73151852 W +
208
73151853-73152060 N
contig_2925
73152061-73153563 W +
232
73153564-73153795 N
contig_2926
73153796-73218018 W +