bases per tick :
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5
2
kb first site :
homology :
D.rerio
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
BC070023
Representative transcript
genome : 45,580,219 - 45,608,250 (28,032)
query : 1 - 3,847 (3,847/3,864)
26 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000078368
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_025622
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000022305
Macaca
sp. (Macaque) : ENSMMUT00000046328
Mus
sp. (Mouse) : AK155818
Rattus
sp. (Rat) : XM_001068034
Canis
sp. (Dog) : XM_538704
Equus
sp. (Horse) : ENSECAT00000008600
Bos
sp. (Cow) : BC142238
Monodelphis
sp. (Opossum) : ENSMODT00000004757
Gallus
sp. (Chicken) : ENSGALT00000022916
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000012737
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00006091001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000154211
ENSDART00000083294
genome : 45,580,207 - 45,608,250 (28,044)
query : 1 - 3,860 (3,860/3,860)
26 exons
identity = 1.000
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1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_685738
genome : 45,580,215 - 45,608,306 (28,092)
query : 1 - 3,908 (3,908/3,908)
26 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
BC155549
genome : 45,580,435 - 45,608,332 (27,898)
query : 1 - 3,077 (3,077/3,096)
23 exons
identity = 0.956
3'(1.000;1.000;0.973;1.000;0.992;0.969;0.991;
0.978;0.989)5'
coverage = 0.999
DDBJ
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_685671
Representative transcript
genome : 45,608,854 - 45,663,300 (54,447)
query : 1 - 4,950 (4,950/4,950)
38 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000000078
Pan
sp. (Chimpanzee) : XR_022885
Macaca
sp. (Macaque) : XR_011266
Mus
sp. (Mouse) : EF591876
Rattus
sp. (Rat) : ENSRNOT00000062017
Canis
sp. (Dog) : XM_536294
Equus
sp. (Horse) : XM_001918332
Bos
sp. (Cow) : XM_613739
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001364919
Gallus
sp. (Chicken) : XM_424706
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000012936
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000140442
ENSDART00000106710
Representative transcript
genome : 45,612,211 - 45,612,296 (86)
query : 1 - 86 (86/86)
1 exon
identity = 1.000
3'(1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSDART00000050979
Representative transcript
genome : 45,665,124 - 45,691,932 (26,809)
query : 1 - 1,017 (1,017/1,017)
7 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000039613
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_001172979
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000007698
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001099348
Mus
sp. (Mouse) : AK044090
Rattus
sp. (Rat) : XM_236376
Canis
sp. (Dog) : XM_535501
Equus
sp. (Horse) : ENSECAT00000013172
Bos
sp. (Cow) : XM_618607
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001377488
Gallus
sp. (Chicken) : CR387250
H.sapiens
(Human) : HIT000429111
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_517651
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000018189
Macaca
sp. (Macaque) : ENSMMUT00000014873
Mus
sp. (Mouse) : ENSMUST00000109592
Rattus
sp. (Rat) : ENSRNOT00000036547
Canis
sp. (Dog) : ENSCAFT00000012696
Equus
sp. (Horse) : XM_001503706
Bos
sp. (Cow) : BC122751
Monodelphis
sp. (Opossum) : ENSMODT00000025573
Gallus
sp. (Chicken) : XM_429122
Zv7_scaffold472
45596077-45676076 W +