bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
C.familiaris
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
ENSCAFT00000016627
genome : 14,317,798 - 14,333,095 (15,298)
query : 1 - 1,941 (1,941/1,941)
12 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSCAFT00000016638
genome : 14,317,798 - 14,333,095 (15,298)
query : 1 - 1,649 (1,649/1,649)
10 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
XM_535804
Representative transcript
genome : 14,317,804 - 14,349,979 (32,176)
query : 1 - 3,576 (3,576/3,576)
21 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000259584
Pan
sp. (Chimpanzee) : XM_517609
Pongo
sp. (Orangutan) : ENSPPYT00000017801
Macaca
sp. (Macaque) : XM_001119131
Mus
sp. (Mouse) : AK085473
Rattus
sp. (Rat) : U12973
Equus
sp. (Horse) : XM_001916176
Bos
sp. (Cow) : BC148024
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001369306
Gallus
sp. (Chicken) : ENSGALT00000021527
Danio
sp. (Zebrafish) : BC059804
Danio
sp. (Zebrafish) : NM_001045223
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000017431
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : CR733339
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000149760
H.sapiens
(Human) : HIT000423608
Pongo
sp. (Orangutan) : CR860498
Macaca
sp. (Macaque) : ENSMMUT00000015303
Mus
sp. (Mouse) : AK014544
Rattus
sp. (Rat) : AJ890206
Equus
sp. (Horse) : XM_001499232
Bos
sp. (Cow) : ENSBTAT00000036630
Gallus
sp. (Chicken) : ENSGALT00000021531
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000017349
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00017549001
ENSCAFT00000016631
genome : 14,319,104 - 14,333,047 (13,944)
query : 1 - 1,548 (1,548/1,548)
11 exons
identity = 0.999
3'(1.000;1.000;1.000;0.992;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSCAFT00000016648
genome : 14,336,436 - 14,349,985 (13,550)
query : 1 - 1,950 (1,950/1,950)
12 exons
identity = 1.000
3'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)5'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
contig_16886
14313891-14330269 W +
191
14330270-14330460 N
contig_16887
14330461-14353890 W +