bases per tick :
2000
1000
500
200
100
50
20
10
5
2
kb first site :
homology :
C.familiaris
sequence viewer :
( start, end )
( middle, total length )
= (
,
)
XM_846322
Representative transcript
genome : 13,875,397 - 14,016,807 (141,411)
query : 1 - 3,366 (3,366/3,366)
20 exons
identity = 1.000
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
RefSeq
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
Ortholog candidate
H.sapiens
(Human) : HIT000005854
Pan
sp. (Chimpanzee) : ENSPTRT00000048339
Pongo
sp. (Orangutan) : CR860078
Macaca
sp. (Macaque) : AB066545
Mus
sp. (Mouse) : AK036052
Mus
sp. (Mouse) : AK045286
Rattus
sp. (Rat) : BC085834
Rattus
sp. (Rat) : XM_001058464
Equus
sp. (Horse) : ENSECAT00000009237
Bos
sp. (Cow) : BC120157
Monodelphis
sp. (Opossum) : XM_001370952
Gallus
sp. (Chicken) : AY555718
Oryzias
sp. (Medaka) : ENSORLT00000000604
Tetraodon
sp. (Tetraodon) : GSTENT00019696001
Takifugu
sp. (Fugu) : SINFRUT00000183355
ENSCAFT00000002746
genome : 13,987,612 - 14,016,270 (28,659)
query : 1 - 1,392 (1,392/1,392)
11 exons
identity = 0.998
5'(1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;1.000;
1.000;0.968;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
ENSCAFT00000002748
genome : 13,987,612 - 14,016,270 (28,659)
query : 1 - 1,395 (1,395/1,395)
11 exons
identity = 0.991
5'(1.000;1.000;1.000;0.847;1.000;1.000;1.000;
1.000;1.000;1.000;1.000)3'
coverage = 1.000
Ensembl
cDNA-genome Alignment
cDNA Multiple Alignment
contig_24843
13866102-14026101 W +