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統計

表1.代表ASバリアント(RASV)

ヒト ヒト マウス マウス ラット チンパンジー アカゲザル イヌ
データセット 完全長cDNA mRNA 完全長cDNA mRNA RNA RNA RNA RNA
総転写物数
(ローカス数)
95160
(27193)
238741
(43538)
121906
(41661)
252615
(75348)
120178
(44077)
92763
(32631)
94104
(35112)
63471
(23757)
RASV数
(ローカス数)
38169
(11538)
60766
(14963)
29756
(10176)
38661
(12025)
22353
(8500)
44687
(11557)
35123
(10651)
29806
(9736)

表2.RASVのASパターン

ヒト ヒト マウス マウス ラット チンパンジー アカゲザル イヌ
データセット 完全長cDNA mRNA 完全長cDNA mRNA RNA RNA RNA RNA

カセット型エクソン
- 複数カセット型含む
23176
(6745)
40271
(9420)
11104
(3690)
16343
(4828)
11373
(3903)
30414
(6819)
22022
(6055)
17340
(4714)

選択的3'スプライス
14073
(4040)
25415
(6039)
5736
(2014)
9444
(2944)
9269
(3342)
19668
(4497)
15535
(4456)
15142
(4244)

選択的5'スプライス
13738
(4067)
25069
(6122)
6310
(2205)
9801
(3071)
9532
(3430)
20898
(4921)
16273
(4730)
16124
(4602)

相互排他的エクソン
2246
(791)
4941
(1393)
545
(191)
1078
(318)
2800
(951)
4895
(1145)
4327
(1387)
4140
(1012)

選択的保持イントロン
11432
(3539)
21215
(5403)
7534
(2675)
11436
(3687)
3335
(1285)
10518
(2430)
7784
(2252)
6026
(1838)
5'末端
選択的第一エクソン
14831
(4295)
25028
(5927)
8685
(2842)
12271
(3567)
6375
(2297)
19282
(4080)
12730
(3326)
7313
(2302)
3'末端
選択的最終エクソン
6329
(1967)
14647
(3584)
6786
(2251)
8976
(2641)
3661
(1245)
8154
(1967)
5680
(1612)
4232
(1297)

表3.タンパク機能に影響を与えるASと複雑なASパターン

ヒト ヒト
データセット 完全長cDNA mRNA
タンパク機能に影響を与えるASの総数 24249
(7273)
36739
(9824)
 タンパク機能モチーフ 19837
(5918)
30753
(7952)
 遺伝子オントロジー(GO) 11075
(3052)
15897
(4556)
 細胞内局在化シグナル 19008
(5309)
26384
(7626)
 膜タンパクドメイン 3521
(1105)
6433
(1607)
複雑なASパターンの総数 3998
(1218)
11463
(2795)
 ブリッジ 1117
(229)
4258
(757)
 ネスト 2904
(1015)
7582
(2223)
 二重CDS 113
(46)
367
(125)

表4.同一スプライスバリアント(ESV)と保存AS

A. ヒト完全長cDNA
対マウス
データセット 完全長cDNA
ESV 3060
(2636)
保存AS 412
(196)

B. ヒトmRNA
対マウス 対ラット 対チンパンジー 対アカゲザル 対イヌ
データセット mRNA RNA RNA RNA RNA
ESV 5071
(3979)
2717
(2084)
7679
(4266)
7116
(3917)
4261
(2961)
保存AS 1148
(484)
730
(292)
5177
(1998)
4894
(1880)
1663
(654)