H-InvDB x AHG DB
Evola
ver. 7.5
H-InvDB_7.5 released on September 10, 2010.
H-InvDB Advanced Search
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[ English ] ↑ 検索例:lung cancer (Keyword)、AB002303, ENST00000338008, NM_173392 (Accession number)、RHEB (Gene symbol)
Evolaとは
    Evola (http://www.h-invitational.jp/evola/) はH-InvDBのヒト遺伝子における脊椎動物のオーソログ情報を提供しています。オーソログ(オルソログ、ortholog)は共通祖先遺伝子から種分化によって生じた遺伝子です。Evolaでは比較ゲノム解析およびアミノ酸配列の相同性解析にもとづいてオーソログを同定しています(Computational analysis)。Evolaではオーソログ群の分子系統解析を行い、遺伝子と生物種の系統関係が一致したオーソログ(Manual curation)およびオーソログ群の分子系統樹も提供しています。また、種間でオーソログのスプライシングバリアントを比較することも可能です。[ Sample ]
    Evolaは無償でご利用いただけます。ご利用の際には下記論文の引用をお願いします。
    Matsuya A, Sakate R, Kawahara Y, et al. Nucleic Acids Res. 2008; 36: D787-92.
更新情報
Evola 7.5 Statistics
Species Genes* Human genes*
Human 
hg19
22,768 -
Chimpanzee 
panTro2
19,169 19,399
Orangutan 
ponAbe2
16,613 16,972
Macaque 
rheMac2
17,355 17,659
Mouse 
mm9
17,492 17,795
Species Genes* Human genes*
Rat 
rn4
15,944 16,316
Dog 
canFam2
16,414 16,875
Horse 
equCab2
15,689 16,250
Cow 
bosTau4
15,688 16,030
Opossum 
monDom5
15,680 16,039
Species Genes* Human genes*
Chicken 
galGal3
11,405 11,984
Zebrafish 
danRer5
14,009 13,291
Medaka 
oryLat2
11,736 11,829
Tetraodon 
tetNig1
11,654 11,579
Fugu 
fr2
12,509 12,414
* 「1対1」オーソログに加えて、「1対多」や「多対多」オーソログが含まれることがあるため、"Genes"と"Human genes"の数は異なります。
Yamanoue et al. 2006 (Euteleostei) and Hedges and Kumar 2009 (the others)

関連サイト - G-compass: Comparative genome browser